聚类散点图是一种常见的分组散点图,常用于展示PCA、NMDS、PCoA、K-means、t-SNE、UMAP等各类降维分析的聚类结果。最近,在文献中看到这样一种带有质心的“烟花状”聚类散点图,如下图,非常有意思。
(RoyalSocietyOpenScience,)
(PloSone,)
闲言少叙,下面就以主成分分析(PCA)的结果展示为例,为大家展示如何使用ggplot2绘制这样的分组散点图。
主成分分析#将R自带的范例数据集iris储存为变量data;data-irishead(data)
#scale.=TRUE表示分析前对数据进行归一化;
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