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如何绘制好看的ldquo烟花状rd

来源:礼花 时间:2022/5/7
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聚类散点图是一种常见的分组散点图,常用于展示PCA、NMDS、PCoA、K-means、t-SNE、UMAP等各类降维分析的聚类结果。最近,在文献中看到这样一种带有质心的“烟花状”聚类散点图,如下图,非常有意思。

(RoyalSocietyOpenScience,)

(PloSone,)

闲言少叙,下面就以主成分分析(PCA)的结果展示为例,为大家展示如何使用ggplot2绘制这样的分组散点图。

主成分分析

#将R自带的范例数据集iris储存为变量data;data-irishead(data)

#scale.=TRUE表示分析前对数据进行归一化;

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